От Петра до Павла
События петровского царствования — выход в Балтику, образование Петербурга и территориальные приобретения по Ништадтскому миру 1721 года — внесли изменения лишь в границы Новгородской епархии. В 1714 году в ее пределах было восстановлено Карельское викариатство, включавшее в себя Кексгольм с уездом и Ладогу. Однако кафедра эта подолгу оставалась вакантной, а с 1742 года не замещалась вовсе. К тому же карельские епископы проживали в одном из новгородских монастырей, не оказывая, таким образом, прямого воздействия на церковную жизнь викариатства.
Практически не затронула границы и секуляризация 1764 года, Но она по-своему определила место каждой епархии в церковной иерархии. Новгородская епархия была (в числе трех) отнесена к 1 классу. В ее пределах выделялось Олонецкое викариатство, заменившее к тому времени фактически ликвидированное Кексгольмское. Оно включало в себя Олонецкий, Каргопольский, Устю-женский уезды, Ясенецкий и Красновский заказы. В связи с образованием Олонецкого викариатства произошло незначительное уточнение его границ с Архангельской епархией.
Вологодская, Устюжская и Архангельская епархии были отнесены к III классу. В последние десятилетия XVIII века правительство Екатерины II, а затем и Павла I постоянно занималось вопросами административно-территориального деления империи. В правительственных и высших церковных кругах рождалась концепция, утверждающая, что церковь должна полностью соответствовать территориально-административной структуре государства: епархиальные границы должны совпадать с границами губерний, а духовная власть архиерея сосуществовать с губернаторской. Явно назревал пересмотр границ северно-российских епархий.
В архангельских и олонецких землях это заняло несколько лет и проходило в два этапа. 15 марта 1787 года Архангельская епархия поглотила Олонецкое викариатство. Территория новой епархии стала совпадать с границами двух одноименных губерний, Архангельской и Олонецкой. Епископ получал титул Архангельского и Олонецкого.
Но по Павловской губернской реформе 1797 г. Олонецкая губерния была ликвидирована, а ее территория была поделена между Новгородской и Архангельской, церкви — между новгородским и архангельским владыками. В Новгородскую епархию были переданы Петрозаводский, Олонецкий, Каргопольский, Вытегорский уезды и Лодейное поле В Архангельскую — Повенецкий, Пудожский и Кемский. Архангельские епископы вновь стали именоваться Архангельскими и Холмогорскими.
Однако в том же 1797 году в рамках Новгородской епархии было учреждено Старорусское викариатство. Его епископ получал права полусамостоятельного епархиального архиерея, и в его ведение передавались, помимо Старорусского уезда, церкви и монастыри Петрозаводского, Олонецкого, Каргопольского, Вытегорского уездов и Лодейного поля, а также возвращались приходы двух уездов Архангельской губернии — Пудожского и Повенецкого.
В 1788 году была упразднена Устюжская епархия. Все церкви передавались в ведение Вологодской епархии. После соединения в 1796 году Вологодской губернии и Великоустюжской области в одну губернию и здесь наступило полное совпадение губернских границ с епархиальными. Правда, для этого вологодскому архиерею пришлось отпустить в юрисдикцию новгородского владыки церкви и монастыри Белозерского, Кирилловского и Череповецкого уездов. Архиереи стали именоваться Вологодскими и Устюжскими.